REMARK SPARTA+ Protein Chemical Shift Prediction Table REMARK REMARK All chemical shifts are reported in ppm: REMARK REMARK SS_SHIFT is the predicted secondary chemical shift. REMARK SHIFT is the predicted chemical shift. REMARK RC_SHIFT is the random coil chemical shift. REMARK HM_SHIFT is the ring current shift; a correction REMARK of 0.6 times this value is applied. REMARK EF_SHIFT is the adjustment for electric field effect, REMARK applied to proton shifts only. REMARK SIGMA is the estimated prediction error. REMARK REMARK Reference: REMARK Y. Shen and A. Bax: SPARTA+: a modest improvement in empirical NMR REMARK chemical shift prediction by means of an artificial neural network. REMARK J. Biomol. NMR 48, 13-22 (2010). DATA SOURCE 1lvf_1_B DATA FIRST_RESID 3 DATA SEQUENCE MEDPFFVVKG EVQKAVNTAQ GLFQRWTELL QGPSAATREE IDWTTNELRN DATA SEQUENCE NLRSIEWDLE DLDETISIVE ANXXXXNLDA TELSIRKAFI TSTRQIVRDM DATA SEQUENCE KDQMSASS VARS RESID RESNAME ATOMNAME SS_SHIFT SHIFT RC_SHIFT HM_SHIFT EF_SHIFT SIGMA FORMAT %4d %4s %4s %9.3f %9.3f %9.3f %9.3f %9.3f %9.3f 3 M HA 0.000 nan 4.480 nan 0.000 0.227 3 M C 0.000 176.326 176.300 0.043 0.000 1.140 3 M CA 0.000 55.318 55.300 0.030 0.000 0.988 3 M CB 0.000 32.613 32.600 0.022 0.000 1.302 4 E N 0.580 120.817 120.200 0.061 0.000 2.561 4 E HA 0.307 4.657 4.350 -0.000 0.000 0.254 4 E C -0.487 176.169 176.600 0.093 0.000 1.213 4 E CA -0.994 55.465 56.400 0.097 0.000 0.995 4 E CB 1.000 30.782 29.700 0.138 0.000 1.233 4 E HN 0.425 nan 8.360 nan 0.000 0.556 5 D N 0.890 121.367 120.400 0.129 0.000 2.371 5 D HA 0.027 4.667 4.640 -0.000 0.000 0.256 5 D C -1.722 174.580 176.300 0.004 0.000 1.193 5 D CA -1.751 52.267 54.000 0.029 0.000 0.881 5 D CB 1.021 41.777 40.800 -0.073 0.000 1.143 5 D HN 0.054 nan 8.370 nan 0.000 0.473 6 P HA -0.135 nan 4.420 nan 0.000 0.218 6 P C 1.322 178.593 177.300 -0.048 0.000 1.146 6 P CA 0.554 63.652 63.100 -0.004 0.000 0.813 6 P CB -0.038 31.666 31.700 0.005 0.000 0.778 7 F N -0.028 119.766 119.950 -0.259 0.000 2.063 7 F HA -0.263 4.264 4.527 -0.000 0.000 0.298 7 F C 1.914 177.547 175.800 -0.278 0.000 1.109 7 F CA 1.689 59.487 58.000 -0.337 0.000 1.212 7 F CB -1.095 37.561 39.000 -0.574 0.000 0.973 7 F HN -0.155 nan 8.300 nan 0.000 0.480 8 F N -0.520 119.356 119.950 -0.124 0.000 2.171 8 F HA -0.212 4.315 4.527 -0.000 0.000 0.300 8 F C 2.297 177.963 175.800 -0.224 0.000 1.090 8 F CA 0.983 58.847 58.000 -0.225 0.000 1.293 8 F CB -0.991 37.991 39.000 -0.031 0.000 1.013 8 F HN -0.157 nan 8.300 nan 0.000 0.486 9 V N -0.140 119.787 119.914 0.021 0.000 2.237 9 V HA -0.275 3.845 4.120 -0.000 0.000 0.245 9 V C 2.264 178.317 176.094 -0.069 0.000 1.046 9 V CA 1.751 64.047 62.300 -0.007 0.000 1.007 9 V CB -0.815 31.011 31.823 0.005 0.000 0.638 9 V HN 0.176 nan 8.190 nan 0.000 0.445 10 V N 0.112 119.957 119.914 -0.114 0.000 2.490 10 V HA -0.293 3.827 4.120 -0.000 0.000 0.250 10 V C 2.405 178.409 176.094 -0.150 0.000 1.061 10 V CA 2.284 64.521 62.300 -0.105 0.000 1.064 10 V CB -0.832 30.941 31.823 -0.084 0.000 0.670 10 V HN 0.587 nan 8.190 nan 0.000 0.461 11 K N 0.616 120.800 120.400 -0.361 0.000 2.057 11 K HA -0.151 4.169 4.320 -0.000 0.000 0.207 11 K C 2.208 178.722 176.600 -0.143 0.000 1.049 11 K CA 1.690 57.725 56.287 -0.420 0.000 0.931 11 K CB -0.618 31.358 32.500 -0.874 0.000 0.714 11 K HN 0.478 nan 8.250 nan 0.000 0.440 12 G N 1.179 109.912 108.800 -0.112 0.000 2.442 12 G HA2 -0.240 3.720 3.960 -0.000 0.000 0.219 12 G HA3 -0.240 3.720 3.960 -0.000 0.000 0.219 12 G C 1.233 176.131 174.900 -0.004 0.000 1.141 12 G CA 0.644 45.720 45.100 -0.039 0.000 0.763 12 G HN 0.328 nan 8.290 nan 0.000 0.554 13 E N 0.470 120.666 120.200 -0.006 0.000 2.077 13 E HA -0.084 4.266 4.350 -0.000 0.000 0.193 13 E C 2.870 179.494 176.600 0.038 0.000 0.989 13 E CA 0.776 57.185 56.400 0.014 0.000 0.800 13 E CB -0.675 29.032 29.700 0.012 0.000 0.746 13 E HN 0.332 nan 8.360 nan 0.000 0.452 14 V N 1.799 121.752 119.914 0.065 0.000 2.295 14 V HA -0.282 3.838 4.120 -0.000 0.000 0.246 14 V C 2.488 178.646 176.094 0.105 0.000 1.049 14 V CA 1.887 64.249 62.300 0.104 0.000 1.024 14 V CB -0.606 31.347 31.823 0.217 0.000 0.648 14 V HN 0.258 nan 8.190 nan 0.000 0.447 15 Q N -0.100 119.784 119.800 0.139 0.000 2.096 15 Q HA -0.291 4.049 4.340 -0.000 0.000 0.204 15 Q C 2.372 178.408 176.000 0.060 0.000 0.982 15 Q CA 2.041 57.913 55.803 0.114 0.000 0.850 15 Q CB -0.311 28.487 28.738 0.099 0.000 0.901 15 Q HN 0.620 nan 8.270 nan 0.000 0.422 16 K N 0.616 121.042 120.400 0.044 0.000 2.009 16 K HA -0.182 4.138 4.320 -0.000 0.000 0.210 16 K C 2.071 178.688 176.600 0.028 0.000 1.049 16 K CA 1.373 57.678 56.287 0.030 0.000 0.929 16 K CB -0.193 32.319 32.500 0.022 0.000 0.714 16 K HN 0.169 nan 8.250 nan 0.000 0.440 17 A N 0.692 123.529 122.820 0.028 0.000 1.930 17 A HA -0.072 4.248 4.320 -0.000 0.000 0.217 17 A C 2.257 179.848 177.584 0.012 0.000 1.175 17 A CA 1.461 53.511 52.037 0.021 0.000 0.627 17 A CB -0.546 18.467 19.000 0.022 0.000 0.815 17 A HN 0.197 nan 8.150 nan 0.000 0.443 18 V N 1.118 121.037 119.914 0.009 0.000 2.261 18 V HA -0.276 3.844 4.120 -0.000 0.000 0.246 18 V C 2.291 178.386 176.094 0.003 0.000 1.047 18 V CA 2.171 64.465 62.300 -0.011 0.000 1.015 18 V CB -0.862 30.953 31.823 -0.014 0.000 0.642 18 V HN 0.585 nan 8.190 nan 0.000 0.446 19 N N -0.227 118.485 118.700 0.020 0.000 2.244 19 N HA -0.130 4.610 4.740 -0.000 0.000 0.183 19 N C 1.858 177.389 175.510 0.034 0.000 1.016 19 N CA 1.868 54.935 53.050 0.028 0.000 0.866 19 N CB -0.216 38.290 38.487 0.031 0.000 0.980 19 N HN 0.470 nan 8.380 nan 0.000 0.430 20 T N 1.083 115.655 114.554 0.031 0.000 2.777 20 T HA 0.000 4.350 4.350 -0.000 0.000 0.266 20 T C 2.053 176.782 174.700 0.047 0.000 1.040 20 T CA 1.121 63.242 62.100 0.036 0.000 1.141 20 T CB -0.157 68.728 68.868 0.028 0.000 0.868 20 T HN 0.296 nan 8.240 nan 0.000 0.444 21 A N 1.473 124.314 122.820 0.034 0.000 1.902 21 A HA -0.158 4.162 4.320 -0.000 0.000 0.217 21 A C 2.265 179.895 177.584 0.077 0.000 1.181 21 A CA 1.462 53.521 52.037 0.037 0.000 0.623 21 A CB -0.628 18.364 19.000 -0.012 0.000 0.818 21 A HN 0.540 nan 8.150 nan 0.000 0.443 22 Q N -0.757 119.078 119.800 0.058 0.000 2.124 22 Q HA -0.102 4.238 4.340 -0.000 0.000 0.202 22 Q C 2.182 178.282 176.000 0.166 0.000 0.977 22 Q CA 1.191 57.054 55.803 0.100 0.000 0.850 22 Q CB -0.415 28.353 28.738 0.050 0.000 0.901 22 Q HN 0.685 nan 8.270 nan 0.000 0.429 23 G N 0.804 109.673 108.800 0.116 0.000 2.402 23 G HA2 -0.196 3.764 3.960 -0.000 0.000 0.216 23 G HA3 -0.196 3.764 3.960 -0.000 0.000 0.216 23 G C 1.371 176.352 174.900 0.135 0.000 1.162 23 G CA 0.359 45.525 45.100 0.110 0.000 0.777 23 G HN 0.173 nan 8.290 nan 0.000 0.539 24 L N -0.773 120.535 121.223 0.142 0.000 2.201 24 L HA 0.095 4.435 4.340 -0.000 0.000 0.212 24 L C 2.452 179.464 176.870 0.236 0.000 1.105 24 L CA 0.431 55.368 54.840 0.162 0.000 0.775 24 L CB -0.247 41.892 42.059 0.134 0.000 0.913 24 L HN 0.234 nan 8.230 nan 0.000 0.440 25 F N 0.193 120.199 119.950 0.094 0.000 2.259 25 F HA -0.160 4.367 4.527 -0.000 0.000 0.298 25 F C 2.620 178.546 175.800 0.210 0.000 1.088 25 F CA 1.192 59.270 58.000 0.131 0.000 1.358 25 F CB -0.049 38.973 39.000 0.037 0.000 1.040 25 F HN 0.026 nan 8.300 nan 0.000 0.505 26 Q N 0.277 120.185 119.800 0.180 0.000 2.020 26 Q HA -0.219 4.121 4.340 -0.000 0.000 0.202 26 Q C 2.392 178.411 176.000 0.032 0.000 0.982 26 Q CA 1.637 57.487 55.803 0.079 0.000 0.838 26 Q CB -0.608 28.191 28.738 0.103 0.000 0.899 26 Q HN 0.292 nan 8.270 nan 0.000 0.423 27 R N 0.150 120.698 120.500 0.081 0.000 2.083 27 R HA -0.179 4.161 4.340 -0.000 0.000 0.237 27 R C 1.871 178.206 176.300 0.059 0.000 1.137 27 R CA 1.876 58.017 56.100 0.070 0.000 0.951 27 R CB -1.081 29.282 30.300 0.105 0.000 0.851 27 R HN 0.333 nan 8.270 nan 0.000 0.434 28 W N 0.847 122.092 121.300 -0.093 0.000 2.318 28 W HA -0.223 4.437 4.660 -0.000 0.000 0.313 28 W C 1.909 178.303 176.519 -0.209 0.000 1.221 28 W CA 2.801 60.068 57.345 -0.130 0.000 1.266 28 W CB -0.780 28.596 29.460 -0.141 0.000 1.150 28 W HN 0.099 nan 8.180 nan 0.000 0.496 29 T N -0.003 114.452 114.554 -0.165 0.000 2.708 29 T HA -0.306 4.044 4.350 -0.000 0.000 0.266 29 T C 1.584 176.115 174.700 -0.282 0.000 1.037 29 T CA 1.837 63.745 62.100 -0.321 0.000 1.146 29 T CB -0.521 68.184 68.868 -0.271 0.000 0.865 29 T HN 0.423 nan 8.240 nan 0.000 0.435 30 E N 0.899 120.994 120.200 -0.174 0.000 2.051 30 E HA -0.113 4.237 4.350 -0.000 0.000 0.192 30 E C 1.987 178.486 176.600 -0.168 0.000 0.991 30 E CA 0.911 57.232 56.400 -0.132 0.000 0.799 30 E CB -0.250 29.408 29.700 -0.069 0.000 0.748 30 E HN 0.454 nan 8.360 nan 0.000 0.449 31 L N 1.037 122.142 121.223 -0.198 0.000 2.549 31 L HA -0.110 4.230 4.340 -0.000 0.000 0.229 31 L C 2.297 178.991 176.870 -0.294 0.000 1.158 31 L CA 0.202 54.918 54.840 -0.207 0.000 0.842 31 L CB -0.343 41.611 42.059 -0.175 0.000 0.952 31 L HN 0.269 nan 8.230 nan 0.000 0.452 32 L N -0.459 120.519 121.223 -0.408 0.000 2.353 32 L HA -0.198 4.142 4.340 -0.000 0.000 0.220 32 L C 2.396 179.119 176.870 -0.244 0.000 1.133 32 L CA 0.864 55.452 54.840 -0.421 0.000 0.798 32 L CB -0.448 41.315 42.059 -0.493 0.000 0.922 32 L HN 0.408 nan 8.230 nan 0.000 0.445 33 Q N 0.108 119.795 119.800 -0.189 0.000 2.364 33 Q HA 0.001 4.341 4.340 -0.000 0.000 0.209 33 Q C 1.241 177.175 176.000 -0.111 0.000 0.977 33 Q CA 0.583 56.310 55.803 -0.127 0.000 0.885 33 Q CB -0.071 28.608 28.738 -0.099 0.000 0.941 33 Q HN 0.611 nan 8.270 nan 0.000 0.464 34 G N -0.107 108.616 108.800 -0.128 0.000 2.545 34 G HA2 -0.229 3.731 3.960 -0.000 0.000 0.216 34 G HA3 -0.229 3.731 3.960 -0.000 0.000 0.216 34 G C -2.263 172.588 174.900 -0.083 0.000 1.314 34 G CA -0.434 44.604 45.100 -0.103 0.000 0.906 34 G HN 0.026 nan 8.290 nan 0.000 0.563 35 P HA -0.103 nan 4.420 nan 0.000 0.218 35 P C 2.222 179.494 177.300 -0.047 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N 0.521 121.783 121.223 0.065 0.000 2.093 61 L HA -0.152 4.188 4.340 -0.000 0.000 0.208 61 L C 2.424 179.318 176.870 0.040 0.000 1.085 61 L CA 0.864 55.727 54.840 0.037 0.000 0.755 61 L CB -0.253 41.778 42.059 -0.046 0.000 0.904 61 L HN -0.047 nan 8.230 nan 0.000 0.435 62 E N 0.722 120.937 120.200 0.026 0.000 2.051 62 E HA -0.228 4.122 4.350 -0.000 0.000 0.192 62 E C 1.691 178.355 176.600 0.107 0.000 0.991 62 E CA 1.603 58.020 56.400 0.029 0.000 0.799 62 E CB -0.044 29.646 29.700 -0.017 0.000 0.748 62 E HN 0.327 nan 8.360 nan 0.000 0.449 63 D N -0.232 120.264 120.400 0.159 0.000 2.144 63 D HA -0.124 4.516 4.640 -0.000 0.000 0.199 63 D C 1.976 178.341 176.300 0.109 0.000 0.984 63 D CA 0.852 54.934 54.000 0.137 0.000 0.834 63 D CB -0.138 40.742 40.800 0.132 0.000 0.955 63 D HN 0.271 nan 8.370 nan 0.000 0.465 64 L N 0.285 121.581 121.223 0.121 0.000 2.109 64 L HA -0.105 4.235 4.340 -0.000 0.000 0.207 64 L C 2.119 179.064 176.870 0.126 0.000 1.086 64 L CA 0.769 55.702 54.840 0.154 0.000 0.760 64 L CB -0.218 41.980 42.059 0.231 0.000 0.910 64 L HN -0.085 nan 8.230 nan 0.000 0.437 65 D N 0.468 120.926 120.400 0.096 0.000 2.084 65 D HA -0.245 4.395 4.640 -0.000 0.000 0.194 65 D C 2.084 178.412 176.300 0.047 0.000 0.990 65 D CA 1.319 55.356 54.000 0.062 0.000 0.826 65 D CB 0.150 40.969 40.800 0.033 0.000 0.971 65 D HN 0.220 nan 8.370 nan 0.000 0.453 66 E N -1.035 119.196 120.200 0.051 0.000 2.153 66 E HA -0.142 4.208 4.350 -0.000 0.000 0.194 66 E C 1.689 178.313 176.600 0.039 0.000 0.988 66 E CA 1.274 57.700 56.400 0.044 0.000 0.811 66 E CB 0.096 29.830 29.700 0.057 0.000 0.746 66 E HN 0.241 nan 8.360 nan 0.000 0.466 67 T N 0.850 115.433 114.554 0.049 0.000 2.737 67 T HA -0.097 4.252 4.350 -0.000 0.000 0.265 67 T C 1.840 176.551 174.700 0.019 0.000 1.038 67 T CA 1.076 63.198 62.100 0.037 0.000 1.144 67 T CB -0.106 68.793 68.868 0.053 0.000 0.866 67 T HN 0.183 nan 8.240 nan 0.000 0.434 68 I N 1.047 121.629 120.570 0.020 0.000 2.394 68 I HA -0.149 4.021 4.170 -0.000 0.000 0.251 68 I C 2.763 178.877 176.117 -0.005 0.000 1.136 68 I CA 0.714 62.010 61.300 -0.006 0.000 1.425 68 I CB -0.390 37.605 38.000 -0.008 0.000 1.079 68 I HN 0.253 nan 8.210 nan 0.000 0.425 69 S N 1.401 117.105 115.700 0.007 0.000 2.374 69 S HA -0.194 4.276 4.470 -0.000 0.000 0.227 69 S C 2.020 176.621 174.600 0.001 0.000 1.037 69 S CA 1.518 59.720 58.200 0.004 0.000 1.024 69 S CB -0.288 62.918 63.200 0.010 0.000 0.861 69 S HN 0.356 nan 8.310 nan 0.000 0.456 70 I N 0.934 121.505 120.570 0.003 0.000 2.202 70 I HA -0.112 4.058 4.170 -0.000 0.000 0.242 70 I C 2.306 178.419 176.117 -0.006 0.000 1.091 70 I CA 0.960 62.260 61.300 0.001 0.000 1.368 70 I CB -0.563 37.440 38.000 0.004 0.000 1.058 70 I HN 0.180 nan 8.210 nan 0.000 0.410 71 V N 0.907 120.814 119.914 -0.012 0.000 2.392 71 V HA -0.280 3.840 4.120 -0.000 0.000 0.249 71 V C 2.318 178.399 176.094 -0.021 0.000 1.059 71 V CA 1.942 64.230 62.300 -0.021 0.000 1.051 71 V CB -0.698 31.103 31.823 -0.036 0.000 0.658 71 V HN 0.461 nan 8.190 nan 0.000 0.455 72 E N -0.102 120.087 120.200 -0.018 0.000 2.158 72 E HA -0.046 4.304 4.350 -0.000 0.000 0.191 72 E C 2.327 178.921 176.600 -0.011 0.000 0.982 72 E CA 0.948 57.339 56.400 -0.016 0.000 0.823 72 E CB -0.245 29.447 29.700 -0.014 0.000 0.766 72 E HN 0.608 nan 8.360 nan 0.000 0.468 73 A N 1.665 124.480 122.820 -0.008 0.000 1.902 73 A HA -0.168 4.152 4.320 -0.000 0.000 0.217 73 A C 1.650 179.230 177.584 -0.006 0.000 1.181 73 A CA 1.492 53.526 52.037 -0.006 0.000 0.623 73 A CB -1.463 17.535 19.000 -0.003 0.000 0.818 73 A HN 0.359 nan 8.150 nan 0.000 0.443 80 L N 1.437 122.639 121.223 -0.035 0.000 2.257 80 L HA 0.495 4.835 4.340 -0.000 0.000 0.290 80 L C -0.407 176.438 176.870 -0.043 0.000 1.044 80 L CA -0.008 54.802 54.840 -0.051 0.000 0.810 80 L CB 0.585 42.595 42.059 -0.082 0.000 1.193 80 L HN 0.177 nan 8.230 nan 0.000 0.425 81 D N 4.126 124.505 120.400 -0.035 0.000 2.488 81 D HA 0.028 4.668 4.640 -0.000 0.000 0.238 81 D C 1.044 177.323 176.300 -0.034 0.000 1.138 81 D CA 0.743 54.727 54.000 -0.026 0.000 0.873 81 D CB 1.312 42.102 40.800 -0.016 0.000 1.183 81 D HN 0.745 nan 8.370 nan 0.000 0.458 82 A N 2.567 125.371 122.820 -0.026 0.000 1.940 82 A HA -0.220 4.100 4.320 -0.000 0.000 0.219 82 A C 2.093 179.661 177.584 -0.026 0.000 1.176 82 A CA 2.323 54.345 52.037 -0.026 0.000 0.631 82 A CB -0.757 18.232 19.000 -0.018 0.000 0.814 82 A HN 0.699 nan 8.150 nan 0.000 0.446 83 T N -2.137 112.405 114.554 -0.020 0.000 2.857 83 T HA -0.119 4.231 4.350 -0.000 0.000 0.266 83 T C 1.698 176.384 174.700 -0.023 0.000 1.048 83 T CA 1.533 63.624 62.100 -0.015 0.000 1.139 83 T CB -0.263 68.601 68.868 -0.006 0.000 0.874 83 T HN 0.473 nan 8.240 nan 0.000 0.455 84 E N 1.184 121.363 120.200 -0.036 0.000 2.106 84 E HA -0.030 4.320 4.350 -0.000 0.000 0.192 84 E C 1.954 178.485 176.600 -0.115 0.000 0.984 84 E CA 0.551 56.914 56.400 -0.062 0.000 0.806 84 E CB -0.661 29.001 29.700 -0.064 0.000 0.750 84 E HN 0.432 nan 8.360 nan 0.000 0.458 85 L N 0.086 121.249 121.223 -0.100 0.000 2.083 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-0.466 0.000 0.858 88 R HN 0.329 nan 8.270 nan 0.000 0.435 89 K N 0.528 120.962 120.400 0.058 0.000 2.103 89 K HA -0.104 4.216 4.320 -0.000 0.000 0.207 89 K C 2.158 178.810 176.600 0.086 0.000 1.048 89 K CA 1.449 57.775 56.287 0.065 0.000 0.930 89 K CB -0.152 32.361 32.500 0.021 0.000 0.716 89 K HN 0.151 nan 8.250 nan 0.000 0.444 90 A N 0.947 123.826 122.820 0.097 0.000 1.930 90 A HA -0.157 4.163 4.320 -0.000 0.000 0.217 90 A C 1.967 179.627 177.584 0.126 0.000 1.175 90 A CA 1.018 53.108 52.037 0.089 0.000 0.627 90 A CB -0.609 18.441 19.000 0.084 0.000 0.815 90 A HN 0.370 nan 8.150 nan 0.000 0.443 91 F N 0.812 120.805 119.950 0.072 0.000 2.102 91 F HA -0.150 4.377 4.527 -0.000 0.000 0.298 91 F C 1.906 177.749 175.800 0.072 0.000 1.105 91 F CA 1.652 59.710 58.000 0.096 0.000 1.239 91 F CB -0.249 38.866 39.000 0.192 0.000 0.991 91 F HN 0.186 nan 8.300 nan 0.000 0.474 92 I N -0.324 120.273 120.570 0.045 0.000 2.142 92 I HA -0.319 3.851 4.170 -0.000 0.000 0.240 92 I C 2.271 178.308 176.117 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