REMARK SPARTA+ Protein Chemical Shift Prediction Table REMARK REMARK All chemical shifts are reported in ppm: REMARK REMARK SS_SHIFT is the predicted secondary chemical shift. REMARK SHIFT is the predicted chemical shift. REMARK RC_SHIFT is the random coil chemical shift. REMARK HM_SHIFT is the ring current shift; a correction REMARK of 0.6 times this value is applied. REMARK EF_SHIFT is the adjustment for electric field effect, REMARK applied to proton shifts only. REMARK SIGMA is the estimated prediction error. REMARK REMARK Reference: REMARK Y. Shen and A. Bax: SPARTA+: a modest improvement in empirical NMR REMARK chemical shift prediction by means of an artificial neural network. REMARK J. Biomol. NMR 48, 13-22 (2010). DATA SOURCE 1yj9_1_F DATA FIRST_RESID 1 DATA SEQUENCE PVYVDFDVPA DLEDDALEAL EVARDTGAVK KGTNETTKSI ERGSAELVFV DATA SEQUENCE AEDVQPEEIV MHIPELADEK GVPFIFVEQQ DDLGHAAGLE VGSAAAAVTD DATA SEQUENCE AGEADADVED IADKVEELR VARS RESID RESNAME ATOMNAME SS_SHIFT SHIFT RC_SHIFT HM_SHIFT EF_SHIFT SIGMA FORMAT %4d %4s %4s %9.3f %9.3f %9.3f %9.3f %9.3f %9.3f 1 P HA 0.000 nan 4.420 nan 0.000 0.216 1 P C 0.000 177.002 177.300 -0.496 0.000 1.155 1 P CA 0.000 62.744 63.100 -0.594 0.000 0.800 1 P CB 0.000 31.488 31.700 -0.353 0.000 0.726 2 V N -0.799 118.818 119.914 -0.495 0.000 2.871 2 V HA -0.043 4.077 4.120 0.000 0.000 0.256 2 V C 1.854 177.864 176.094 -0.140 0.000 1.082 2 V CA 1.674 63.834 62.300 -0.234 0.000 1.105 2 V CB -1.234 30.522 31.823 -0.111 0.000 0.713 2 V HN 0.398 nan 8.190 nan 0.000 0.473 3 Y N -0.379 119.873 120.300 -0.079 0.000 2.458 3 Y HA 0.687 5.237 4.550 0.000 0.000 0.256 3 Y C 0.613 176.498 175.900 -0.024 0.000 1.159 3 Y CA -1.328 56.751 58.100 -0.035 0.000 1.261 3 Y CB -0.963 37.476 38.460 -0.035 0.000 1.119 3 Y HN 0.017 nan 8.280 nan 0.000 0.524 4 V N 3.148 122.909 119.914 -0.254 0.000 2.385 4 V HA 0.127 4.247 4.120 0.000 0.000 0.269 4 V C -0.066 175.981 176.094 -0.079 0.000 1.043 4 V CA -0.339 61.734 62.300 -0.379 0.000 0.906 4 V CB 1.114 32.458 31.823 -0.797 0.000 0.995 4 V HN 0.330 nan 8.190 nan 0.000 0.467 5 D N 4.589 125.063 120.400 0.123 0.000 2.431 5 D HA 0.234 4.874 4.640 0.000 0.000 0.213 5 D C -0.332 176.150 176.300 0.303 0.000 1.130 5 D CA 0.533 54.649 54.000 0.193 0.000 0.834 5 D CB 0.808 41.791 40.800 0.305 0.000 0.985 5 D HN 0.544 nan 8.370 nan 0.000 0.504 6 F N -0.750 119.359 119.950 0.265 0.000 2.690 6 F HA 0.389 4.916 4.527 0.000 0.000 0.311 6 F C -1.690 174.244 175.800 0.223 0.000 1.111 6 F CA -1.467 56.644 58.000 0.184 0.000 1.003 6 F CB 0.831 39.910 39.000 0.133 0.000 1.283 6 F HN -0.397 nan 8.300 nan 0.000 0.442 7 D N 1.879 122.476 120.400 0.329 0.000 2.198 7 D HA 0.553 5.193 4.640 0.000 0.000 0.245 7 D C -1.021 175.465 176.300 0.310 0.000 1.079 7 D CA -0.339 53.799 54.000 0.230 0.000 0.854 7 D CB 2.055 42.922 40.800 0.112 0.000 1.148 7 D HN 0.582 nan 8.370 nan 0.000 0.456 8 V N 6.177 126.269 119.914 0.297 0.000 2.372 8 V HA 0.262 4.382 4.120 0.000 0.000 0.261 8 V C -1.895 174.284 176.094 0.142 0.000 1.055 8 V CA -1.544 60.905 62.300 0.249 0.000 0.930 8 V CB 0.691 32.677 31.823 0.272 0.000 1.031 8 V HN 0.635 nan 8.190 nan 0.000 0.479 9 P HA -0.052 nan 4.420 nan 0.000 0.259 9 P C 1.032 178.371 177.300 0.065 0.000 1.163 9 P CA 0.638 63.780 63.100 0.070 0.000 0.760 9 P CB 0.647 32.377 31.700 0.050 0.000 0.762 10 A N 4.718 127.572 122.820 0.057 0.000 1.944 10 A HA -0.327 3.993 4.320 0.000 0.000 0.222 10 A C 1.916 179.532 177.584 0.053 0.000 1.237 10 A CA 2.414 54.483 52.037 0.054 0.000 0.668 10 A CB -1.130 17.895 19.000 0.041 0.000 0.830 10 A HN 0.526 nan 8.150 nan 0.000 0.471 11 D N -0.699 119.727 120.400 0.044 0.000 2.117 11 D HA -0.095 4.545 4.640 0.000 0.000 0.198 11 D C 1.964 178.290 176.300 0.044 0.000 0.982 11 D CA 1.146 55.170 54.000 0.040 0.000 0.828 11 D CB -0.421 40.397 40.800 0.030 0.000 0.967 11 D HN 0.486 nan 8.370 nan 0.000 0.464 12 L N 1.065 122.313 121.223 0.042 0.000 2.079 12 L HA -0.228 4.112 4.340 0.000 0.000 0.210 12 L C 2.393 179.294 176.870 0.052 0.000 1.081 12 L CA 1.456 56.318 54.840 0.037 0.000 0.752 12 L CB -0.076 42.001 42.059 0.031 0.000 0.896 12 L HN -0.006 nan 8.230 nan 0.000 0.433 13 E N -0.109 120.133 120.200 0.070 0.000 2.031 13 E HA -0.274 4.076 4.350 0.000 0.000 0.193 13 E C 1.734 178.398 176.600 0.107 0.000 0.994 13 E CA 1.805 58.261 56.400 0.094 0.000 0.800 13 E CB -0.041 29.721 29.700 0.103 0.000 0.752 13 E HN 0.511 nan 8.360 nan 0.000 0.447 14 D N 0.810 121.263 120.400 0.087 0.000 2.133 14 D HA -0.200 4.440 4.640 0.000 0.000 0.192 14 D C 1.618 177.972 176.300 0.091 0.000 1.001 14 D CA 1.519 55.570 54.000 0.085 0.000 0.844 14 D CB -0.368 40.470 40.800 0.062 0.000 0.944 14 D HN 0.311 nan 8.370 nan 0.000 0.447 15 D N 0.873 121.318 120.400 0.075 0.000 2.116 15 D HA -0.146 4.494 4.640 0.000 0.000 0.193 15 D C 2.095 178.459 176.300 0.106 0.000 0.998 15 D CA 1.326 55.369 54.000 0.071 0.000 0.836 15 D CB -0.399 40.428 40.800 0.047 0.000 0.951 15 D HN 0.169 nan 8.370 nan 0.000 0.449 16 A N 0.889 123.786 122.820 0.129 0.000 1.858 16 A HA -0.141 4.179 4.320 0.000 0.000 0.216 16 A C 2.476 180.287 177.584 0.378 0.000 1.190 16 A CA 1.067 53.241 52.037 0.230 0.000 0.617 16 A CB -0.907 18.161 19.000 0.113 0.000 0.827 16 A HN 0.205 nan 8.150 nan 0.000 0.443 17 L N -0.678 120.727 121.223 0.304 0.000 2.042 17 L HA -0.240 4.100 4.340 0.000 0.000 0.210 17 L C 2.655 179.591 176.870 0.111 0.000 1.076 17 L CA 1.752 56.720 54.840 0.214 0.000 0.749 17 L CB -0.681 41.480 42.059 0.170 0.000 0.893 17 L HN 0.502 nan 8.230 nan 0.000 0.432 18 E N 0.214 120.476 120.200 0.103 0.000 2.038 18 E HA -0.247 4.103 4.350 0.000 0.000 0.195 18 E C 2.307 178.939 176.600 0.053 0.000 1.000 18 E CA 1.248 57.687 56.400 0.065 0.000 0.803 18 E CB -0.248 29.488 29.700 0.060 0.000 0.750 18 E HN 0.504 nan 8.360 nan 0.000 0.448 19 A N 1.141 124.009 122.820 0.080 0.000 2.024 19 A HA -0.190 4.130 4.320 0.000 0.000 0.220 19 A C 2.122 179.729 177.584 0.039 0.000 1.164 19 A CA 1.046 53.126 52.037 0.073 0.000 0.643 19 A CB -0.444 18.624 19.000 0.114 0.000 0.806 19 A HN 0.190 nan 8.150 nan 0.000 0.451 20 L N 0.049 121.277 121.223 0.008 0.000 2.005 20 L HA -0.110 4.230 4.340 0.000 0.000 0.207 20 L C 2.220 179.025 176.870 -0.107 0.000 1.072 20 L CA 2.355 57.116 54.840 -0.132 0.000 0.744 20 L CB -0.782 41.075 42.059 -0.337 0.000 0.895 20 L HN 0.520 nan 8.230 nan 0.000 0.433 21 E N -0.729 119.426 120.200 -0.076 0.000 2.085 21 E HA -0.222 4.128 4.350 0.000 0.000 0.194 21 E C 2.171 178.741 176.600 -0.049 0.000 0.994 21 E CA 1.839 58.196 56.400 -0.072 0.000 0.801 21 E CB -0.380 29.290 29.700 -0.050 0.000 0.743 21 E HN 0.582 nan 8.360 nan 0.000 0.453 22 V N -1.039 118.860 119.914 -0.026 0.000 2.515 22 V HA -0.051 4.069 4.120 0.000 0.000 0.250 22 V C 2.202 178.285 176.094 -0.019 0.000 1.058 22 V CA 1.613 63.904 62.300 -0.015 0.000 1.064 22 V CB -0.586 31.237 31.823 0.000 0.000 0.675 22 V HN 0.197 nan 8.190 nan 0.000 0.461 23 A N 1.710 124.516 122.820 -0.024 0.000 2.066 23 A HA -0.049 4.271 4.320 0.000 0.000 0.218 23 A C 2.410 179.970 177.584 -0.039 0.000 1.157 23 A CA 1.271 53.293 52.037 -0.024 0.000 0.670 23 A CB -0.599 18.389 19.000 -0.021 0.000 0.804 23 A HN 0.763 nan 8.150 nan 0.000 0.453 24 R N -1.080 119.386 120.500 -0.057 0.000 2.323 24 R HA 0.020 4.360 4.340 0.000 0.000 0.198 24 R C -0.059 176.213 176.300 -0.046 0.000 0.988 24 R CA 1.380 57.442 56.100 -0.063 0.000 1.041 24 R CB -0.101 30.146 30.300 -0.087 0.000 0.926 24 R HN 0.350 nan 8.270 nan 0.000 0.476 25 D N -0.476 119.903 120.400 -0.035 0.000 2.415 25 D HA 0.050 4.690 4.640 0.000 0.000 0.269 25 D C 0.806 177.096 176.300 -0.018 0.000 1.099 25 D CA 0.517 54.501 54.000 -0.026 0.000 0.865 25 D CB 0.855 41.640 40.800 -0.025 0.000 1.359 25 D HN 0.148 nan 8.370 nan 0.000 0.506 26 T N -0.289 114.256 114.554 -0.016 0.000 3.031 26 T HA 0.217 4.567 4.350 0.000 0.000 0.254 26 T C 1.217 175.912 174.700 -0.009 0.000 1.060 26 T CA 0.798 62.892 62.100 -0.009 0.000 1.135 26 T CB 0.936 69.801 68.868 -0.005 0.000 0.896 26 T HN 0.161 nan 8.240 nan 0.000 0.472 27 G N 0.690 109.484 108.800 -0.011 0.000 3.382 27 G HA2 0.716 4.676 3.960 0.000 0.000 0.183 27 G HA3 0.716 4.676 3.960 0.000 0.000 0.183 27 G C -1.410 173.482 174.900 -0.014 0.000 1.246 27 G CA 0.047 45.142 45.100 -0.009 0.000 0.828 27 G HN 0.482 nan 8.290 nan 0.000 0.728 28 A N -0.979 121.833 122.820 -0.013 0.000 2.498 28 A HA 0.832 5.152 4.320 0.000 0.000 0.298 28 A C -0.810 176.760 177.584 -0.023 0.000 1.075 28 A CA -0.114 51.913 52.037 -0.017 0.000 0.714 28 A CB 1.750 20.744 19.000 -0.010 0.000 1.299 28 A HN 1.972 nan 8.150 nan 0.000 0.407 29 V N -1.616 118.278 119.914 -0.033 0.000 3.078 29 V HA 0.844 4.964 4.120 0.000 0.000 0.311 29 V C -1.330 174.743 176.094 -0.036 0.000 1.138 29 V CA -1.164 61.108 62.300 -0.046 0.000 1.007 29 V CB 2.189 33.960 31.823 -0.087 0.000 1.045 29 V HN 0.685 nan 8.190 nan 0.000 0.432 30 K N 2.174 122.555 120.400 -0.032 0.000 2.413 30 K HA 0.554 4.874 4.320 0.000 0.000 0.257 30 K C -0.991 175.593 176.600 -0.025 0.000 0.946 30 K CA -0.395 55.881 56.287 -0.019 0.000 0.823 30 K CB 2.014 34.514 32.500 0.000 0.000 1.109 30 K HN 0.899 nan 8.250 nan 0.000 0.427 31 K N 0.640 121.026 120.400 -0.025 0.000 2.159 31 K HA 0.712 5.032 4.320 0.000 0.000 0.266 31 K C 0.143 176.739 176.600 -0.006 0.000 0.975 31 K CA -0.952 55.321 56.287 -0.023 0.000 0.865 31 K CB 1.391 33.874 32.500 -0.029 0.000 1.087 31 K HN 0.683 nan 8.250 nan 0.000 0.446 32 G N 1.336 110.137 108.800 0.002 0.000 2.895 32 G HA2 -0.208 3.752 3.960 0.000 0.000 0.686 32 G HA3 -0.208 3.752 3.960 0.000 0.000 0.686 32 G C 0.471 175.381 174.900 0.016 0.000 1.108 32 G CA -0.438 44.668 45.100 0.010 0.000 0.761 32 G HN 0.524 nan 8.290 nan 0.000 0.611 33 T N 1.699 116.266 114.554 0.022 0.000 2.699 33 T HA -0.238 4.112 4.350 0.000 0.000 0.268 33 T C 2.279 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-0.564 37.446 38.000 0.018 0.000 1.062 40 I HN 0.393 nan 8.210 nan 0.000 0.426 41 E N 0.793 121.011 120.200 0.029 0.000 2.051 41 E HA -0.084 4.266 4.350 0.000 0.000 0.189 41 E C 1.852 178.465 176.600 0.022 0.000 0.979 41 E CA 0.598 57.015 56.400 0.027 0.000 0.803 41 E CB -0.064 29.653 29.700 0.028 0.000 0.761 41 E HN 0.457 nan 8.360 nan 0.000 0.451 42 R N 0.326 120.838 120.500 0.020 0.000 2.340 42 R HA 0.070 4.410 4.340 0.000 0.000 0.215 42 R C 1.193 177.503 176.300 0.017 0.000 1.017 42 R CA 0.430 56.539 56.100 0.016 0.000 1.111 42 R CB -0.008 30.301 30.300 0.015 0.000 1.049 42 R HN 0.310 nan 8.270 nan 0.000 0.490 43 G N 1.021 109.833 108.800 0.020 0.000 2.413 43 G HA2 -0.435 3.525 3.960 0.000 0.000 0.259 43 G HA3 -0.435 3.525 3.960 0.000 0.000 0.259 43 G C 0.904 175.817 174.900 0.021 0.000 1.003 43 G CA 1.004 46.116 45.100 0.020 0.000 0.629 43 G HN 0.517 nan 8.290 nan 0.000 0.548 44 S N 0.077 115.788 115.700 0.019 0.000 3.077 44 S HA 0.552 5.022 4.470 0.000 0.000 0.244 44 S C 0.712 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0.433 67 A N -0.802 122.022 122.820 0.007 0.000 1.877 67 A HA -0.220 4.100 4.320 0.000 0.000 0.216 67 A C 1.837 179.511 177.584 0.150 0.000 1.186 67 A CA 1.796 53.894 52.037 0.101 0.000 0.620 67 A CB -1.003 18.125 19.000 0.212 0.000 0.822 67 A HN 0.559 nan 8.150 nan 0.000 0.443 68 D N 0.353 120.873 120.400 0.200 0.000 2.420 68 D HA -0.097 4.543 4.640 0.000 0.000 0.233 68 D C 0.719 177.071 176.300 0.087 0.000 1.017 68 D CA 1.278 55.375 54.000 0.161 0.000 0.951 68 D CB -0.197 40.718 40.800 0.192 0.000 0.877 68 D HN 0.920 nan 8.370 nan 0.000 0.528 69 E N -0.460 119.782 120.200 0.070 0.000 3.191 69 E HA 0.166 4.516 4.350 0.000 0.000 0.192 69 E C 0.439 177.063 176.600 0.040 0.000 0.972 69 E CA -0.442 55.987 56.400 0.048 0.000 1.266 69 E CB 0.525 30.252 29.700 0.044 0.000 1.076 69 E HN -0.157 nan 8.360 nan 0.000 0.462 70 K N -0.090 120.337 120.400 0.044 0.000 2.617 70 K HA 0.143 4.463 4.320 0.000 0.000 0.184 70 K C 0.906 177.527 176.600 0.034 0.000 1.295 70 K CA 0.382 56.691 56.287 0.037 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nan 8.290 nan 0.000 0.504 93 S N -1.515 114.206 115.700 0.036 0.000 2.619 93 S HA 0.523 4.993 4.470 0.000 0.000 0.280 93 S C 0.991 175.616 174.600 0.043 0.000 1.150 93 S CA 0.335 58.553 58.200 0.030 0.000 0.978 93 S CB 1.392 64.602 63.200 0.017 0.000 1.041 93 S HN 1.217 nan 8.310 nan 0.000 0.485 94 A N 3.873 126.716 122.820 0.037 0.000 1.883 94 A HA 0.503 4.823 4.320 0.000 0.000 0.217 94 A C 1.064 178.677 177.584 0.048 0.000 1.186 94 A CA 1.468 53.529 52.037 0.039 0.000 0.624 94 A CB -0.601 18.413 19.000 0.024 0.000 0.822 94 A HN 1.760 nan 8.150 nan 0.000 0.444 95 A N -2.720 120.125 122.820 0.042 0.000 2.566 95 A HA 0.700 5.020 4.320 0.000 0.000 0.297 95 A C -0.505 177.112 177.584 0.055 0.000 1.059 95 A CA 0.111 52.185 52.037 0.062 0.000 0.691 95 A CB 0.525 19.529 19.000 0.006 0.000 1.282 95 A HN 1.691 nan 8.150 nan 0.000 0.401 96 A N 0.326 123.201 122.820 0.092 0.000 2.485 96 A HA 1.048 5.368 4.320 0.000 0.000 0.292 96 A C -0.234 177.404 177.584 0.090 0.000 1.147 96 A CA -0.166 51.891 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103 E HN 1.813 nan 8.360 nan 0.000 0.445 104 A N -0.974 121.854 122.820 0.014 0.000 2.600 104 A HA 0.192 4.512 4.320 0.000 0.000 0.252 104 A C 1.030 178.629 177.584 0.025 0.000 1.200 104 A CA 0.355 52.405 52.037 0.023 0.000 0.981 104 A CB 0.464 19.481 19.000 0.028 0.000 1.207 104 A HN 0.118 nan 8.150 nan 0.000 0.577 105 D N 1.369 121.780 120.400 0.018 0.000 2.092 105 D HA -0.093 4.548 4.640 0.000 0.000 0.193 105 D C 2.252 178.559 176.300 0.011 0.000 0.994 105 D CA 1.866 55.876 54.000 0.016 0.000 0.828 105 D CB -0.131 40.675 40.800 0.010 0.000 0.963 105 D HN 0.443 nan 8.370 nan 0.000 0.450 106 A N 1.350 124.175 122.820 0.008 0.000 1.859 106 A HA -0.289 4.031 4.320 0.000 0.000 0.218 106 A C 1.819 179.406 177.584 0.006 0.000 1.209 106 A CA 2.264 54.303 52.037 0.004 0.000 0.639 106 A CB -0.920 18.083 19.000 0.004 0.000 0.835 106 A HN 0.157 nan 8.150 nan 0.000 0.450 107 D N -0.278 120.130 120.400 0.012 0.000 2.156 107 D HA -0.177 4.463 4.640 0.000 0.000 0.190 107 D C 2.117 178.427 176.300 0.017 0.000 0.998 107 D CA 1.995 56.005 54.000 0.017 0.000 0.842 107 D CB -0.935 39.883 40.800 0.029 0.000 0.974 107 D HN 0.201 nan 8.370 nan 0.000 0.447 108 V N 1.391 121.323 119.914 0.030 0.000 2.231 108 V HA -0.311 3.809 4.120 0.000 0.000 0.250 108 V C 2.594 178.689 176.094 0.002 0.000 1.058 108 V CA 2.324 64.644 62.300 0.032 0.000 1.022 108 V CB -0.672 31.181 31.823 0.050 0.000 0.640 108 V HN 0.276 nan 8.190 nan 0.000 0.445 109 E N -0.234 119.966 120.200 0.000 0.000 2.108 109 E HA -0.313 4.037 4.350 0.000 0.000 0.203 109 E C 1.856 178.440 176.600 -0.027 0.000 1.022 109 E CA 2.004 58.396 56.400 -0.013 0.000 0.823 109 E CB -0.138 29.557 29.700 -0.009 0.000 0.744 109 E HN 0.691 nan 8.360 nan 0.000 0.456 110 D N -0.087 120.300 120.400 -0.022 0.000 2.162 110 D HA -0.092 4.548 4.640 0.000 0.000 0.203 110 D C 2.140 178.413 176.300 -0.045 0.000 0.967 110 D CA 0.803 54.784 54.000 -0.031 0.000 0.840 110 D CB -0.115 40.673 40.800 -0.020 0.000 0.972 110 D HN 0.354 nan 8.370 nan 0.000 0.482 111 I N 1.747 122.293 120.570 -0.039 0.000 2.179 111 I HA -0.251 3.919 4.170 0.000 0.000 0.242 111 I C 2.681 178.737 176.117 -0.101 0.000 1.088 111 I CA 0.979 62.243 61.300 -0.060 0.000 1.357 111 I CB -0.398 37.577 38.000 -0.042 0.000 1.051 111 I HN -0.098 nan 8.210 nan 0.000 0.409 112 A N 0.970 123.734 122.820 -0.093 0.000 1.892 112 A HA -0.272 4.048 4.320 0.000 0.000 0.218 112 A C 1.984 179.482 177.584 -0.142 0.000 1.188 112 A CA 2.365 54.328 52.037 -0.123 0.000 0.631 112 A CB -0.684 18.265 19.000 -0.085 0.000 0.822 112 A HN 0.429 nan 8.150 nan 0.000 0.447 113 D N -0.330 120.006 120.400 -0.107 0.000 2.085 113 D HA -0.111 4.529 4.640 0.000 0.000 0.199 113 D C 1.877 178.103 176.300 -0.123 0.000 0.981 113 D CA 1.436 55.373 54.000 -0.106 0.000 0.834 113 D CB -0.476 40.280 40.800 -0.074 0.000 0.992 113 D HN 0.474 nan 8.370 nan 0.000 0.457 114 K N 0.643 120.980 120.400 -0.104 0.000 2.127 114 K HA -0.166 4.154 4.320 0.000 0.000 0.212 114 K C 2.224 178.733 176.600 -0.151 0.000 1.050 114 K CA 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