data_26891

#######################
#  Entry information  #
#######################

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   _Saveframe_category      entry_information

   _Entry_title
;
Solution and solid-state NMR studies of soluble tissue factor
;
   _BMRB_accession_number   26891
   _BMRB_flat_file_name     bmr26891.str
   _Entry_type              original
   _Submission_date         2016-09-08
   _Accession_date          2016-09-08
   _Entry_origination       author
   _NMR_STAR_version        2.1.1
   _Experimental_method     NMR
   _Details                 .

   loop_
      _Author_ordinal
      _Author_family_name
      _Author_given_name
      _Author_middle_initials
      _Author_family_title

      1 Nuzzio     Kristin M. .
      2 Watt       Eric    D. .
      3 Boettcher  John    M. .
      4 Gajsiewicz Joshua  M. .
      5 Morrissey  James   H. .
      6 Rienstra   Chad    M. .

   stop_

   loop_
      _Saveframe_category_type
      _Saveframe_category_type_count

      spectral_peak_list 5

   stop_

   loop_
      _Revision_date
      _Revision_keyword
      _Revision_author
      _Revision_detail

      2016-10-04 original BMRB .

   stop_

   _Original_release_date   2016-10-04

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#############################
#  Citation for this entry  #
#############################

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   _Saveframe_category           entry_citation

   _Citation_full                .
   _Citation_title
;
High-Resolution NMR Studies of Human Tissue Factor
;
   _Citation_status              published
   _Citation_type                journal
   _CAS_abstract_code            .
   _MEDLINE_UI_code              .
   _PubMed_ID                    27657719

   loop_
      _Author_ordinal
      _Author_family_name
      _Author_given_name
      _Author_middle_initials
      _Author_family_title

      1 Nuzzio     Kristin M. .
      2 Watt       Eric    D. .
      3 Boettcher  John    M. .
      4 Gajsiewicz Joshua  M. .
      5 Morrissey  James   H. .
      6 Rienstra   Chad    M. .

   stop_

   _Journal_abbreviation        'PLOS ONE'
   _Journal_volume               11
   _Journal_issue                9
   _Journal_CSD                  .
   _Book_chapter_title           .
   _Book_volume                  .
   _Book_series                  .
   _Book_ISBN                    .
   _Conference_state_province    .
   _Conference_abstract_number   .
   _Page_first                   e0163206
   _Page_last                    e0163206
   _Year                         2016
   _Details                      .

   loop_
      _Keyword

      'blood coagulation'
      'solid-state NMR'
      'soluble tissue factor'
      'solution NMR'

   stop_

save_


##################################
#  Molecular system description  #
##################################

save_assembly
   _Saveframe_category         molecular_system

   _Mol_system_name           'sTF monomer'
   _Enzyme_commission_number   .

   loop_
      _Mol_system_component_name
      _Mol_label

      'sTF monomer' $Extracellular_domain_of_tissue_factor

   stop_

   _System_molecular_weight    .
   _System_physical_state      native
   _System_oligomer_state      ?
   _System_paramagnetic        no
   _System_thiol_state         .
   _Database_query_date        .
   _Details                    .

save_


    ########################
    #  Monomeric polymers  #
    ########################

save_Extracellular_domain_of_tissue_factor
   _Saveframe_category                          monomeric_polymer

   _Mol_type                                    polymer
   _Mol_polymer_class                           protein
   _Name_common                                 Extracellular_domain_of_tissue_factor
   _Molecular_mass                              .
   _Mol_thiol_state                            'not reported'
   _Details                                     .

   	##############################
   	#  Polymer residue sequence  #
   	##############################

      _Residue_count                               229
   _Mol_residue_sequence
;
ATTNTVAAYNLTWKSTNFKT
ILEWEPKPVNQVYTVQISTK
SGDWKSKCFYTTDTECDLTD
EIVKDVKQTYLARVFSYPAG
NVESTGSAGEPLYENSPEFT
PYLETNLGQPTIQSFEQVGT
KVNVTVEDERTLVRRNNTFL
SLRDVFGKDLIYTLYYWKSS
SSGKKTAKTNTNEFLIDVDK
GENYCFSVQAVIPSRTVNRK
STDSPVECMGQEKGEFREGG
AAGHHHHHH
;

   loop_
      _Residue_seq_code
      _Residue_label

        1 ALA    2 THR    3 THR    4 ASN    5 THR
        6 VAL    7 ALA    8 ALA    9 TYR   10 ASN
       11 LEU   12 THR   13 TRP   14 LYS   15 SER
       16 THR   17 ASN   18 PHE   19 LYS   20 THR
       21 ILE   22 LEU   23 GLU   24 TRP   25 GLU
       26 PRO   27 LYS   28 PRO   29 VAL   30 ASN
       31 GLN   32 VAL   33 TYR   34 THR   35 VAL
       36 GLN   37 ILE   38 SER   39 THR   40 LYS
       41 SER   42 GLY   43 ASP   44 TRP   45 LYS
       46 SER   47 LYS   48 CYS   49 PHE   50 TYR
       51 THR   52 THR   53 ASP   54 THR   55 GLU
       56 CYS   57 ASP   58 LEU   59 THR   60 ASP
       61 GLU   62 ILE   63 VAL   64 LYS   65 ASP
       66 VAL   67 LYS   68 GLN   69 THR   70 TYR
       71 LEU   72 ALA   73 ARG   74 VAL   75 PHE
       76 SER   77 TYR   78 PRO   79 ALA   80 GLY
       81 ASN   82 VAL   83 GLU   84 SER   85 THR
       86 GLY   87 SER   88 ALA   89 GLY   90 GLU
       91 PRO   92 LEU   93 TYR   94 GLU   95 ASN
       96 SER   97 PRO   98 GLU   99 PHE  100 THR
      101 PRO  102 TYR  103 LEU  104 GLU  105 THR
      106 ASN  107 LEU  108 GLY  109 GLN  110 PRO
      111 THR  112 ILE  113 GLN  114 SER  115 PHE
      116 GLU  117 GLN  118 VAL  119 GLY  120 THR
      121 LYS  122 VAL  123 ASN  124 VAL  125 THR
      126 VAL  127 GLU  128 ASP  129 GLU  130 ARG
      131 THR  132 LEU  133 VAL  134 ARG  135 ARG
      136 ASN  137 ASN  138 THR  139 PHE  140 LEU
      141 SER  142 LEU  143 ARG  144 ASP  145 VAL
      146 PHE  147 GLY  148 LYS  149 ASP  150 LEU
      151 ILE  152 TYR  153 THR  154 LEU  155 TYR
      156 TYR  157 TRP  158 LYS  159 SER  160 SER
      161 SER  162 SER  163 GLY  164 LYS  165 LYS
      166 THR  167 ALA  168 LYS  169 THR  170 ASN
      171 THR  172 ASN  173 GLU  174 PHE  175 LEU
      176 ILE  177 ASP  178 VAL  179 ASP  180 LYS
      181 GLY  182 GLU  183 ASN  184 TYR  185 CYS
      186 PHE  187 SER  188 VAL  189 GLN  190 ALA
      191 VAL  192 ILE  193 PRO  194 SER  195 ARG
      196 THR  197 VAL  198 ASN  199 ARG  200 LYS
      201 SER  202 THR  203 ASP  204 SER  205 PRO
      206 VAL  207 GLU  208 CYS  209 MET  210 GLY
      211 GLN  212 GLU  213 LYS  214 GLY  215 GLU
      216 PHE  217 ARG  218 GLU  219 GLY  220 GLY
      221 ALA  222 ALA  223 GLY  224 HIS  225 HIS
      226 HIS  227 HIS  228 HIS  229 HIS

   stop_

   _Sequence_homology_query_date                .
   _Sequence_homology_query_revised_last_date   .

save_


    ####################
    #  Natural source  #
    ####################

save_natural_source
   _Saveframe_category   natural_source


   loop_
      _Mol_label
      _Organism_name_common
      _NCBI_taxonomy_ID
      _Superkingdom
      _Kingdom
      _Genus
      _Species

      $Extracellular_domain_of_tissue_factor Human 9606 Eukaryota Metazoa Homo sapiens

   stop_

save_


    #########################
    #  Experimental source  #
    #########################

save_experimental_source
   _Saveframe_category   experimental_source


   loop_
      _Mol_label
      _Production_method
      _Host_organism_name_common
      _Genus
      _Species
      _Strain
      _Vector_name

      $Extracellular_domain_of_tissue_factor 'recombinant technology' . Escherichia coli . pJH677

   stop_

save_


#####################################
#  Sample contents and methodology  #
#####################################

    ########################
    #  Sample description  #
    ########################

save_sample_1
   _Saveframe_category   sample

   _Sample_type          solution
   _Details              .

   loop_
      _Mol_label
      _Concentration_value
      _Concentration_value_units
      _Isotopic_labeling

      $Extracellular_domain_of_tissue_factor 100    uM  [U-15N]
      'sodium phosphate'                      50    mM 'natural abundance'
      'sodium chloride'                       50    mM 'natural abundance'
      'sodium azide'                           0.01 %  'natural abundance'
       DSS                                     1    mM 'natural abundance'
       D2O                                    10    %  '[U-99% 2H]'

   stop_

save_


save_sample_2
   _Saveframe_category   sample

   _Sample_type          solid
   _Details              .

   loop_
      _Mol_label
      _Concentration_value
      _Concentration_value_units
      _Isotopic_labeling

      $Extracellular_domain_of_tissue_factor  45 mg/mL '[U-100% 13C; U-100% 15N]'
      'Polyethylene Glycol 3350'              20 %     'natural abundance'
      'sodium phosphate'                      25 mM    'natural abundance'
      'sodium chloride'                      200 mM    'natural abundance'

   stop_

save_


save_sample_3
   _Saveframe_category   sample

   _Sample_type          solid
   _Details              .

   loop_
      _Mol_label
      _Concentration_value
      _Concentration_value_units
      _Isotopic_labeling

      $Extracellular_domain_of_tissue_factor  45   mg/mL '[U-100% 13C; U-100% 15N]'
       HEPES                                 100   mM    'natural abundance'
      'sodium chloride'                      200   mM    'natural abundance'
      'copper EDTA'                            5   mM    'natural abundance'
      'ammonium sulfate'                       1.8 M     'natural abundance'

   stop_

save_


save_sample_4
   _Saveframe_category   sample

   _Sample_type          solid
   _Details              .

   loop_
      _Mol_label
      _Concentration_value
      _Concentration_value_units
      _Isotopic_labeling

      $Extracellular_domain_of_tissue_factor  45   mg/mL '[U-100% 2-gly 13C; U-100% 15N; U-80% 2H]'
       HEPES                                 100   mM    'natural abundance'
      'sodium chloride'                      200   mM    'natural abundance'
      'copper EDTA'                            5   mM    'natural abundance'
      'ammonium sulfate'                       1.8 M     'natural abundance'

   stop_

save_


############################
#  Computer software used  #
############################

save_VNMRJ
   _Saveframe_category   software

   _Name                 VNMRJ
   _Version              .

   loop_
      _Vendor
      _Address
      _Electronic_address

      Varian . .

   stop_

   loop_
      _Task

      collection

   stop_

   _Details              .

save_


save_SPARKY
   _Saveframe_category   software

   _Name                 SPARKY
   _Version              .

   loop_
      _Vendor
      _Address
      _Electronic_address

      Goddard . .

   stop_

   loop_
      _Task

      'peak picking'

   stop_

   _Details              .

save_


#########################
#  Experimental detail  #
#########################

    ##################################
    #  NMR Spectrometer definitions  #
    ##################################

save_spectrometer_1
   _Saveframe_category   NMR_spectrometer

   _Manufacturer         Varian
   _Model                VNMRS
   _Field_strength       750
   _Details              .

save_


save_spectrometer_2
   _Saveframe_category   NMR_spectrometer

   _Manufacturer         Varian
   _Model                VNMRS
   _Field_strength       500
   _Details              .

save_


    #############################
    #  NMR applied experiments  #
    #############################

save_2D_1H-15N_HSQC_1
   _Saveframe_category   NMR_applied_experiment

   _Experiment_name     '2D 1H-15N HSQC'
   _Sample_label        $sample_1

save_


save_2D_13C-13C_DARR_2
   _Saveframe_category   NMR_applied_experiment

   _Experiment_name     '2D 13C-13C DARR'
   _Sample_label        $sample_2

save_


save_2D_13C-13C_DARR_3
   _Saveframe_category   NMR_applied_experiment

   _Experiment_name     '2D 13C-13C DARR'
   _Sample_label        $sample_3

save_


save_2D_15N-13CA_4
   _Saveframe_category   NMR_applied_experiment

   _Experiment_name     '2D 15N-13CA'
   _Sample_label        $sample_3

save_


save_2D_15N-13CA_5
   _Saveframe_category   NMR_applied_experiment

   _Experiment_name     '2D 15N-13CA'
   _Sample_label        $sample_4

save_


save_NMR_spectrometer_expt
   _Saveframe_category                     NMR_applied_experiment

   _Experiment_name                        .
   _BMRB_pulse_sequence_accession_number   .
   _Details                                .

save_


#######################
#  Sample conditions  #
#######################

save_sample_conditions_1
   _Saveframe_category   sample_conditions

   _Details              .

   loop_
      _Variable_type
      _Variable_value
      _Variable_value_error
      _Variable_value_units

      'ionic strength'  90   . mM
       pH                6.5 . pH
       pressure          1   . atm
       temperature     273   . K

   stop_

save_


save_sample_conditions_2
   _Saveframe_category   sample_conditions

   _Details              .

   loop_
      _Variable_type
      _Variable_value
      _Variable_value_error
      _Variable_value_units

      pH            7.5 . pH
      temperature 273   . K

   stop_

save_


save_sample_conditions_3
   _Saveframe_category   sample_conditions

   _Details              .

   loop_
      _Variable_type
      _Variable_value
      _Variable_value_error
      _Variable_value_units

      pH            7.5 . pH
      temperature 273   . K

   stop_

save_


save_1H-15_HSQC
   _Saveframe_category              spectral_peak_list

   _Details                         .
   _Experiment_label               '2D 1H-15N HSQC'
   _Number_of_spectral_dimensions   2

   loop_
      _Expt_dimension_ID
      _Atom_type
      _Spectral_region

      2 H-N HN

   stop_

   _Sample_label                   $sample_1
   _Sample_conditions_label        $sample_conditions_1
   _Text_data_format               "NMR-STAR v3"
   _Text_data
;
>>save_1H-15_HSQC
>>   _Spectral_peak_list.Sf_category                     spectral_peak_list
>>   _Spectral_peak_list.Sf_framecode                    1H-15_HSQC
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