#
set root=ft/B%03d.ft3
set thres=2.2e5

setenv PK_FONT_SIZE 9 
setenv SCLFONT_SIZE 10 
setenv TXT_FONT_SIZE 12 

#setenv POS1_COLOR "light blue"
#setenv POS2_COLOR "light blue"
#setenv NEG1_COLOR "light blue"
#setenv NEG2_COLOR "light blue"
#setenv BACK_COLOR "light blue"

setenv VIEW_IN_PORTRAIT 1
setenv SWITCH_XY_AXIS 1

setenv PLOT_CONTOURS 0
setenv MARK_PEAKS 0
setenv MARK_ID 1
#setenv WRITE_SIM_RMS 0
#setenv RIDGE_SUMM 0
#setenv REPORT_XY_PARAB 0
#setenv REPORT_EXTREMA 0
setenv PRINTER kozmo
setenv PRINT_COM lpr
#setenv POSITIVE_ONLY 1
#setenv NEGATIVE_ONLY 1
#setenv SLEEP_TIME 0.010
setenv MAX_LVLS 30

setenv ACQ_PRM_FRMT NMRI_PIPE
setenv DIM_COUNT 3
setenv FRACTION_X 0.55
setenv FRACTION_Y 0.55

#setenv SLICE_START_Z 1
#setenv SLICE_END_Z 256

#cp ../../assign/update.cs update.cs

setenv STAPP_PAR_FL stapp.par
#setenv SHIFT_FL_NM cbcaconh-1.shifts
#cp cbcaconh-2.shifts Junk.shifts
unalias cp
cp 66040-22-tmp.shifts Junk.shifts
alias cp 'cp -i'
setenv SHIFT_FL_NM Junk.shifts
#setenv ASGNMT_READ_ONLY TRUE
setenv XVW_LBL_FRMT 2
setenv PK_WR_ASSIGN 1
setenv USE_EXTREMA 1
#setenv STD_OUT_CMND my_com

#these three lines below are used to set up contour averaging
setenv XVW_DSPLY_CTL 1
#setenv ELL_FRACT_MIDL_LVL 0.45
#setenv ELL_PERC_MIDL_USE 30

setenv XVW_MAX_PK_XSAME 8.0
setenv XVW_MAX_PK_YSAME 8.0
setenv XVW_MAX_PK_ZSAME 8.0

setenv PK_FILE_NAME  hbhaconh-8.PCK
#setenv PK_TBL_FRMT "%6.3f %6.3f %7.2f"
setenv PK_TBL_FRMT     "%8.3f"
setenv INTENS_PCK_FRMT "%8.6e"
setenv INTENS_PIPP_FRMT "%8.6e"


/usr2/Pipp/bin/pipp $root $thres 1.25